Šv. Mikalojaus bažnyčia (čekų k.: kostel Svatého Mikuláše) yra barokinė bažnyčia Prahos senamiestyje, toje pačioje Voltavos pusėje kaip ir Prahos pilis. Bažnyčia buvo pastatyta tarp 1704-1755 m. toje vietoje, kur anksčiau nuo 13 amžiaus stovėjo gotikinė bažnyčia, taip pat buvo skirta Šv. Mikalojui.
Antroje 17 amžiaus pusėje jėzuitai nusprendė statyti naują bažnyčią, suprojektuotą Giovanni Domenico Orsi. Šv. Mikalojaus bažnyčia tapo pagrindine parapijos bažnyčia senamiestyje 1775 metais.
Komunistinės eros laikais bažnyčios bokštas buvo naudojamas kaip valstybės saugumo observatorija, nes nuo bokšto buvo galima stebėti Amerikos ir Jugoslavijos ambasadas ir kelią, vedantį į į Vakarų Vokietijos ambasadą.
Šv. Mikalojaus bažnyčios interjeras apibūdinamas kaip įspūdingiausias Prahos baroko pavyzdys. Bažnyčia pasižymi ne tik didinga baroko architektūra, bet ir kvapą gniaužiančia apdaila. Vidus išpuoštas Jan Lukas Kracker freskomis, o bažnyčios viduje esantis František Xaver Palko projektuotas 70 m aukščio kupolas sukuria nepaprastą atmosferą. Interjerą taip pat puošia František Ignác Platzer kurtos skulptūros.
Didingi barokiniai vargonai turi daugiau nei 4000 vamzdžius, kai kurie siekia iki šešių metrų ilgio ir jais grojo 1787 m. grojo pats Mocartas, kuriame jo įspūdingas šedevras Mišios C buvo pirmą kartą buvo atliktos Šv. Mikalojaus bažnyčioje netrukus po to, kai jis apsilankė bažnyčioje.
79 m aukščio varpinė yra tiesiogiai susieta su didžiuoju bažnyčios kupolu. Varpinė su plačiu panoraminiu vaizdu, skirtingai nei likusios bažnyčios dalys, yra rokoko formų, ją 1751-1756 m. pabaigė Anselmo Lurago.
Šv. Mikalojaus bažnyčia yra vienas iš objektų, kuriuos būtina pamatyti atvykus į Prahą, nepaisant to, kiek religingi esate.